El accidente mundialmente conocido como Sword Art Online, el juego MMORPG mortal en el que 100000 personas están encerradas. La saga se centra en Kirito, quien es un jugador solitario en este mundo de espadas, tratando de ganar el juego para poder regresar a su mundo.
Tras completar el juego, casi todas las personas que aún vivían volvieron al mundo normal, menos 300 jugadores. Entre esos 300, se encuentra Asuna, quien aún no ha vuelto. Kirito entra al nuevo juego Alfhein Online por una pista que encontró sobre Asuna en el.
Tras los sucesos de Fairy Dance, el gobierno pide ayuda al jugador legendario que salvó a miles de personas en Aincrads, Kirito. Un nuevo incidente está ocurriendo en un juego algo distinto, GGO o Gun Gale Online.
Al fin hay paz, y un nuevo jugador misperioso aparece en ALO. Kirito, Asuna y compañia harán una misión importante y conocerán a este nuevo jugador misterioso y experno en el arte de la espada.
Kirito se ha sumergido en un nuevo mundo virtual de fantasía. Con apenas unos pequeños retazos de recuerdos sobre lo que ocurrió antes de entrar al juego, comienza a vagar por él buscando alguna pista. Finalmente llega a un enorme y oscuro árbol, el Cedro Gigas, donde conoce a un joven